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歐洲生物信息學研究所攜手全球30個實驗室

最新生物學信息圖表標準發(fā)布

　　物理學家組織網(wǎng)8月11日報道稱，歐洲分子生物學實驗室下屬的歐洲生物信息學研究所（EMBL-EBI），與遍布世界的30個實驗室一起聯(lián)合發(fā)布了一套用圖表表示生物學信息的新標準。如同電子學中的電路圖一樣，該套標準圖表的應用將會使生物學研究領域中復雜信息的交流更加容易，使模型變得準確、高效和容易理解。新標準稱為系統(tǒng)生物學圖釋（SBGN），發(fā)表在近期出版的《自然·生物技術》雜志上。

　　標準化的圖表，做為一種視覺語言，被廣泛應用于多個學科領域。使用標準圖表法傳達復雜信息，表意清晰、易于理解。但在圖表信息占據(jù)重要地位的生物學領域，卻一直沒有統(tǒng)一的標準圖表描述所有的生物化學反應、路徑和網(wǎng)絡。

　　2005年，各國的研究人員開始努力開發(fā)一種專門用于分子和系統(tǒng)生物學研究的新圖表標準，即SBGN項目。該項目由日本東京系統(tǒng)生物學研究所的北野宏明發(fā)起，英國辛克斯頓歐洲生物信息學研究所的尼古拉斯·勒·諾瓦克和美國加州理工學院的邁克爾·胡克負責協(xié)調。研究團隊則包括生物化學家、模型制作人員和計算機科學家。

　　勒·諾瓦克指出，在基因組學時代，特別是高通量技術出現(xiàn)之后，生物學數(shù)據(jù)的規(guī)模總量有了大幅度增長，SBGN會使研究人員更容易了解彼此的模型，更有效地分享數(shù)據(jù)。它將使眾多的系統(tǒng)生物學家從中受益，無論他們研究的重點是生化進程中的哪個環(huán)節(jié)。

　　為了確保新圖表不會變得過于龐大、復雜，研究人員定義了三種不同類型的圖解，互相補充，描述分子過程、實體關系和生化活動中的各個環(huán)節(jié)。報道稱，SBGN十分簡單，有眾多研究團體的廣泛參與，相信這種表示法將會迅速得到廣泛的應用。